Nesta legislatura o número de comissões subiu de 12 para 14, integrando as novas Comissão de Administração Pública, Modernização Administrativa, Descentralização e Poder Local (Fernando Ruas – PSD) e Comissão de Transparência e Estatuto dos Deputados (Jorge Lacão - PS).
De acordo com o método de Hondt, a distribuição da presidência das comissões entrega 8 ao PS, 5 ao PSD e 1 ao Bloco de Esquerda.
Finanças, Agricultura, Negócios Estrangeiros, Defesa, Assuntos Europeus, Saúde, Cultura e à nova comissão da Transparência e Estatuto dos Deputados serão presididas pelo partido socialista.
Ao PSD cabe presidir às comissões de Assuntos Constitucionais, Economia, Educação, Trabalho e Segurança Social e à recém-criada Administração Pública Modernização Administrativa, Descentralização e Poder Local.
O Bloco de Esquerda preside à Comissão de Ambiente, Energia e Ordenamento do Território (BE).